Protein–RNA interactions for Protein: P27641

Xrcc5, X-ray repair cross-complementing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 732 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc5P27641 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Xrcc5P27641 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Xrcc5P27641 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Xrcc5P27641 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Xrcc5P27641 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Xrcc5P27641 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Xrcc5P27641 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Xrcc5P27641 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Xrcc5P27641 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Xrcc5P27641 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Xrcc5P27641 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Xrcc5P27641 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Xrcc5P27641 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Xrcc5P27641 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Xrcc5P27641 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Xrcc5P27641 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Xrcc5P27641 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Xrcc5P27641 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Xrcc5P27641 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Xrcc5P27641 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Xrcc5P27641 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Xrcc5P27641 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Xrcc5P27641 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
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Xrcc5P27641 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Xrcc5P27641 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Xrcc5P27641 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Xrcc5P27641 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Xrcc5P27641 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Xrcc5P27641 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Xrcc5P27641 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Xrcc5P27641 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Xrcc5P27641 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Xrcc5P27641 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Xrcc5P27641 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Xrcc5P27641 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Xrcc5P27641 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Xrcc5P27641 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Xrcc5P27641 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Xrcc5P27641 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Xrcc5P27641 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Xrcc5P27641 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Xrcc5P27641 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Xrcc5P27641 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Xrcc5P27641 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Xrcc5P27641 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Xrcc5P27641 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Xrcc5P27641 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Xrcc5P27641 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Xrcc5P27641 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Xrcc5P27641 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Xrcc5P27641 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Xrcc5P27641 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Xrcc5P27641 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Xrcc5P27641 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Xrcc5P27641 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Xrcc5P27641 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Xrcc5P27641 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Xrcc5P27641 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Xrcc5P27641 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Xrcc5P27641 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Xrcc5P27641 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Xrcc5P27641 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Xrcc5P27641 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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