Protein–RNA interactions for Protein: P23979

Htr3a, 5-hydroxytryptamine receptor 3A, mousemouse

Predictions only

Length 487 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htr3aP23979 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Htr3aP23979 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Htr3aP23979 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Htr3aP23979 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Htr3aP23979 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Htr3aP23979 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Htr3aP23979 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Htr3aP23979 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Htr3aP23979 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Htr3aP23979 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Htr3aP23979 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Htr3aP23979 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Htr3aP23979 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Htr3aP23979 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Htr3aP23979 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Htr3aP23979 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Htr3aP23979 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Htr3aP23979 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Htr3aP23979 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Htr3aP23979 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Htr3aP23979 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Htr3aP23979 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Htr3aP23979 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Htr3aP23979 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Htr3aP23979 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Htr3aP23979 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Htr3aP23979 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Htr3aP23979 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Htr3aP23979 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Htr3aP23979 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Htr3aP23979 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Htr3aP23979 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Htr3aP23979 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Htr3aP23979 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Htr3aP23979 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Htr3aP23979 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Htr3aP23979 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Htr3aP23979 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Htr3aP23979 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Htr3aP23979 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Htr3aP23979 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Htr3aP23979 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Htr3aP23979 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Htr3aP23979 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Htr3aP23979 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Htr3aP23979 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Htr3aP23979 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Htr3aP23979 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Htr3aP23979 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Htr3aP23979 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Htr3aP23979 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Htr3aP23979 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Htr3aP23979 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Htr3aP23979 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Htr3aP23979 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Htr3aP23979 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Htr3aP23979 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Htr3aP23979 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Htr3aP23979 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Htr3aP23979 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Htr3aP23979 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Htr3aP23979 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Htr3aP23979 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Htr3aP23979 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Htr3aP23979 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Htr3aP23979 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Htr3aP23979 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Htr3aP23979 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Htr3aP23979 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Htr3aP23979 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Htr3aP23979 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Htr3aP23979 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Htr3aP23979 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Htr3aP23979 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Htr3aP23979 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Htr3aP23979 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Htr3aP23979 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Htr3aP23979 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Htr3aP23979 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Htr3aP23979 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Htr3aP23979 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Htr3aP23979 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Htr3aP23979 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Htr3aP23979 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Htr3aP23979 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Htr3aP23979 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Htr3aP23979 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Htr3aP23979 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Htr3aP23979 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Htr3aP23979 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Htr3aP23979 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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