Protein–RNA interactions for Protein: P23298

Prkch, Protein kinase C eta type, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkchP23298 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PrkchP23298 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PrkchP23298 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PrkchP23298 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PrkchP23298 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PrkchP23298 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PrkchP23298 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PrkchP23298 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PrkchP23298 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PrkchP23298 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PrkchP23298 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PrkchP23298 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PrkchP23298 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PrkchP23298 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PrkchP23298 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PrkchP23298 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PrkchP23298 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PrkchP23298 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PrkchP23298 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PrkchP23298 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PrkchP23298 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PrkchP23298 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PrkchP23298 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PrkchP23298 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PrkchP23298 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PrkchP23298 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PrkchP23298 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PrkchP23298 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PrkchP23298 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PrkchP23298 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PrkchP23298 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PrkchP23298 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PrkchP23298 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PrkchP23298 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PrkchP23298 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PrkchP23298 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PrkchP23298 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PrkchP23298 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PrkchP23298 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PrkchP23298 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PrkchP23298 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PrkchP23298 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PrkchP23298 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PrkchP23298 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PrkchP23298 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PrkchP23298 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PrkchP23298 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PrkchP23298 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PrkchP23298 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PrkchP23298 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PrkchP23298 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PrkchP23298 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PrkchP23298 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PrkchP23298 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PrkchP23298 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PrkchP23298 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PrkchP23298 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PrkchP23298 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PrkchP23298 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PrkchP23298 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PrkchP23298 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PrkchP23298 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PrkchP23298 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PrkchP23298 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PrkchP23298 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PrkchP23298 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PrkchP23298 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PrkchP23298 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PrkchP23298 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PrkchP23298 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PrkchP23298 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PrkchP23298 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PrkchP23298 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PrkchP23298 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
PrkchP23298 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PrkchP23298 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PrkchP23298 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PrkchP23298 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PrkchP23298 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PrkchP23298 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PrkchP23298 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PrkchP23298 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PrkchP23298 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PrkchP23298 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PrkchP23298 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PrkchP23298 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PrkchP23298 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PrkchP23298 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PrkchP23298 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PrkchP23298 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PrkchP23298 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PrkchP23298 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PrkchP23298 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PrkchP23298 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PrkchP23298 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PrkchP23298 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PrkchP23298 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
PrkchP23298 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PrkchP23298 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PrkchP23298 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms