Protein–RNA interactions for Protein: P23204

Ppara, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PparaP23204 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PparaP23204 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PparaP23204 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PparaP23204 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PparaP23204 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PparaP23204 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PparaP23204 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PparaP23204 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PparaP23204 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PparaP23204 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PparaP23204 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PparaP23204 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PparaP23204 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PparaP23204 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PparaP23204 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PparaP23204 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PparaP23204 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PparaP23204 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PparaP23204 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PparaP23204 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PparaP23204 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PparaP23204 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PparaP23204 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PparaP23204 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PparaP23204 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PparaP23204 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PparaP23204 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PparaP23204 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PparaP23204 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PparaP23204 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PparaP23204 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PparaP23204 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PparaP23204 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PparaP23204 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PparaP23204 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PparaP23204 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PparaP23204 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PparaP23204 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PparaP23204 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PparaP23204 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PparaP23204 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PparaP23204 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PparaP23204 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PparaP23204 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PparaP23204 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PparaP23204 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PparaP23204 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PparaP23204 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PparaP23204 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PparaP23204 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PparaP23204 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PparaP23204 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PparaP23204 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PparaP23204 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PparaP23204 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PparaP23204 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PparaP23204 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PparaP23204 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PparaP23204 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PparaP23204 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PparaP23204 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PparaP23204 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PparaP23204 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PparaP23204 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PparaP23204 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PparaP23204 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PparaP23204 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PparaP23204 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PparaP23204 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PparaP23204 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PparaP23204 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PparaP23204 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PparaP23204 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PparaP23204 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PparaP23204 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PparaP23204 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PparaP23204 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PparaP23204 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PparaP23204 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PparaP23204 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PparaP23204 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PparaP23204 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PparaP23204 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PparaP23204 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PparaP23204 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PparaP23204 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PparaP23204 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PparaP23204 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PparaP23204 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PparaP23204 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PparaP23204 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PparaP23204 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PparaP23204 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PparaP23204 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PparaP23204 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PparaP23204 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PparaP23204 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PparaP23204 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PparaP23204 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PparaP23204 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms