Protein–RNA interactions for Protein: P23116

Eif3a, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3aP23116 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Eif3aP23116 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Eif3aP23116 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Eif3aP23116 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Eif3aP23116 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Eif3aP23116 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Eif3aP23116 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Eif3aP23116 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Eif3aP23116 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Eif3aP23116 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Eif3aP23116 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Eif3aP23116 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Eif3aP23116 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Eif3aP23116 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Eif3aP23116 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Eif3aP23116 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Eif3aP23116 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Eif3aP23116 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Eif3aP23116 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Eif3aP23116 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Eif3aP23116 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Eif3aP23116 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Eif3aP23116 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Eif3aP23116 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Eif3aP23116 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Eif3aP23116 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Eif3aP23116 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Eif3aP23116 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Eif3aP23116 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Eif3aP23116 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Eif3aP23116 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Eif3aP23116 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Eif3aP23116 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Eif3aP23116 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Eif3aP23116 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Eif3aP23116 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Eif3aP23116 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Eif3aP23116 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Eif3aP23116 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Eif3aP23116 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Eif3aP23116 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Eif3aP23116 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Eif3aP23116 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Eif3aP23116 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Eif3aP23116 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Eif3aP23116 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Eif3aP23116 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Eif3aP23116 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Eif3aP23116 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Eif3aP23116 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Eif3aP23116 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Eif3aP23116 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Eif3aP23116 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Eif3aP23116 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Eif3aP23116 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Eif3aP23116 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Eif3aP23116 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Eif3aP23116 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Eif3aP23116 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Eif3aP23116 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Eif3aP23116 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Eif3aP23116 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Eif3aP23116 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Eif3aP23116 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Eif3aP23116 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Eif3aP23116 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Eif3aP23116 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Eif3aP23116 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Eif3aP23116 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Eif3aP23116 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Eif3aP23116 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Eif3aP23116 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Eif3aP23116 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Eif3aP23116 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Eif3aP23116 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Eif3aP23116 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Eif3aP23116 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Eif3aP23116 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Eif3aP23116 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Eif3aP23116 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Eif3aP23116 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Eif3aP23116 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Eif3aP23116 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Eif3aP23116 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Eif3aP23116 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Eif3aP23116 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Eif3aP23116 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Eif3aP23116 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Eif3aP23116 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Eif3aP23116 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Eif3aP23116 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Eif3aP23116 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Eif3aP23116 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Eif3aP23116 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Eif3aP23116 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Eif3aP23116 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Eif3aP23116 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Eif3aP23116 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Eif3aP23116 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Eif3aP23116 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms