Protein–RNA interactions for Protein: P19426

Nelfe, Negative elongation factor E, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NelfeP19426 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NelfeP19426 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NelfeP19426 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NelfeP19426 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NelfeP19426 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NelfeP19426 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NelfeP19426 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NelfeP19426 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NelfeP19426 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NelfeP19426 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NelfeP19426 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NelfeP19426 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NelfeP19426 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NelfeP19426 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NelfeP19426 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NelfeP19426 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NelfeP19426 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NelfeP19426 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NelfeP19426 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NelfeP19426 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NelfeP19426 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NelfeP19426 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NelfeP19426 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NelfeP19426 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NelfeP19426 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
NelfeP19426 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NelfeP19426 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NelfeP19426 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NelfeP19426 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NelfeP19426 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NelfeP19426 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NelfeP19426 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NelfeP19426 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NelfeP19426 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NelfeP19426 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NelfeP19426 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NelfeP19426 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NelfeP19426 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NelfeP19426 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NelfeP19426 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NelfeP19426 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NelfeP19426 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NelfeP19426 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NelfeP19426 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NelfeP19426 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NelfeP19426 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NelfeP19426 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NelfeP19426 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NelfeP19426 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NelfeP19426 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NelfeP19426 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NelfeP19426 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NelfeP19426 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NelfeP19426 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NelfeP19426 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NelfeP19426 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
NelfeP19426 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NelfeP19426 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
NelfeP19426 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NelfeP19426 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NelfeP19426 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
NelfeP19426 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NelfeP19426 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NelfeP19426 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NelfeP19426 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NelfeP19426 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NelfeP19426 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NelfeP19426 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NelfeP19426 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NelfeP19426 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NelfeP19426 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NelfeP19426 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NelfeP19426 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NelfeP19426 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NelfeP19426 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NelfeP19426 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NelfeP19426 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NelfeP19426 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NelfeP19426 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NelfeP19426 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NelfeP19426 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NelfeP19426 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NelfeP19426 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NelfeP19426 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NelfeP19426 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NelfeP19426 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NelfeP19426 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NelfeP19426 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
NelfeP19426 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NelfeP19426 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NelfeP19426 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NelfeP19426 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NelfeP19426 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NelfeP19426 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NelfeP19426 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NelfeP19426 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NelfeP19426 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NelfeP19426 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NelfeP19426 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NelfeP19426 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms