Protein–RNA interactions for Protein: P18911

Rarg, Retinoic acid receptor gamma, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RargP18911 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RargP18911 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RargP18911 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RargP18911 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RargP18911 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RargP18911 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RargP18911 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RargP18911 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RargP18911 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RargP18911 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RargP18911 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RargP18911 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RargP18911 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RargP18911 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RargP18911 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RargP18911 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RargP18911 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RargP18911 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RargP18911 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RargP18911 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RargP18911 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RargP18911 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RargP18911 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RargP18911 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RargP18911 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RargP18911 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RargP18911 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RargP18911 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RargP18911 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RargP18911 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RargP18911 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RargP18911 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RargP18911 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RargP18911 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RargP18911 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RargP18911 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RargP18911 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RargP18911 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RargP18911 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RargP18911 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RargP18911 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RargP18911 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RargP18911 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RargP18911 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RargP18911 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RargP18911 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RargP18911 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RargP18911 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RargP18911 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RargP18911 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RargP18911 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RargP18911 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RargP18911 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RargP18911 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RargP18911 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RargP18911 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RargP18911 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RargP18911 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RargP18911 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RargP18911 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RargP18911 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RargP18911 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RargP18911 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RargP18911 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RargP18911 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RargP18911 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RargP18911 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RargP18911 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RargP18911 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RargP18911 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RargP18911 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RargP18911 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RargP18911 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RargP18911 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RargP18911 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RargP18911 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RargP18911 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RargP18911 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RargP18911 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RargP18911 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RargP18911 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RargP18911 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RargP18911 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RargP18911 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RargP18911 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RargP18911 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RargP18911 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RargP18911 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RargP18911 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RargP18911 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RargP18911 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RargP18911 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RargP18911 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RargP18911 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RargP18911 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RargP18911 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RargP18911 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RargP18911 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RargP18911 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RargP18911 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms