Protein–RNA interactions for Protein: P18528

Ig heavy chain V region 6.96, mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18528 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
P18528 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
P18528 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
P18528 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
P18528 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
P18528 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
P18528 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
P18528 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
P18528 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
P18528 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
P18528 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
P18528 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
P18528 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
P18528 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
P18528 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
P18528 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
P18528 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
P18528 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
P18528 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
P18528 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
P18528 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
P18528 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
P18528 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
P18528 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
P18528 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
P18528 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
P18528 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
P18528 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
P18528 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
P18528 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
P18528 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
P18528 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
P18528 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
P18528 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
P18528 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
P18528 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
P18528 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
P18528 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
P18528 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
P18528 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
P18528 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
P18528 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
P18528 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
P18528 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
P18528 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
P18528 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
P18528 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
P18528 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
P18528 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
P18528 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
P18528 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
P18528 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
P18528 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
P18528 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
P18528 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
P18528 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
P18528 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
P18528 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
P18528 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
P18528 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
P18528 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
P18528 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
P18528 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
P18528 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
P18528 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
P18528 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
P18528 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
P18528 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
P18528 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
P18528 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
P18528 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
P18528 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
P18528 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
P18528 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
P18528 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
P18528 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
P18528 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
P18528 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
P18528 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
P18528 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
P18528 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
P18528 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
P18528 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
P18528 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
P18528 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
P18528 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
P18528 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
P18528 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
P18528 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
P18528 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
P18528 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
P18528 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
P18528 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
P18528 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
P18528 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
P18528 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
P18528 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
P18528 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
P18528 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
P18528 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms