Protein–RNA interactions for Protein: P18527

Ig heavy chain V region 914, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18527 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P18527 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P18527 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P18527 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P18527 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P18527 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
P18527 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P18527 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P18527 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P18527 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P18527 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
P18527 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P18527 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P18527 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P18527 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P18527 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
P18527 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P18527 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
P18527 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
P18527 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
P18527 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
P18527 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
P18527 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
P18527 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P18527 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P18527 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P18527 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P18527 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P18527 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P18527 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P18527 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
P18527 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P18527 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
P18527 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P18527 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P18527 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P18527 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P18527 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P18527 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P18527 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
P18527 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
P18527 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P18527 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
P18527 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
P18527 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P18527 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
P18527 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
P18527 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P18527 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P18527 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P18527 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P18527 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
P18527 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
P18527 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P18527 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P18527 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
P18527 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P18527 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P18527 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
P18527 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
P18527 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
P18527 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P18527 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P18527 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
P18527 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
P18527 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
P18527 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
P18527 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P18527 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P18527 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P18527 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P18527 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P18527 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P18527 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
P18527 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P18527 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P18527 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
P18527 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
P18527 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P18527 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P18527 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
P18527 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P18527 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P18527 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P18527 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P18527 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P18527 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P18527 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P18527 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P18527 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P18527 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P18527 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P18527 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P18527 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P18527 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
P18527 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
P18527 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
P18527 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
P18527 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
P18527 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms