Protein–RNA interactions for Protein: P18524

Ig heavy chain V region RF, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18524 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P18524 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P18524 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
P18524 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
P18524 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P18524 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P18524 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P18524 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P18524 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P18524 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P18524 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P18524 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P18524 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
P18524 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P18524 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P18524 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
P18524 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P18524 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P18524 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
P18524 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
P18524 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
P18524 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
P18524 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
P18524 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
P18524 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
P18524 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
P18524 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
P18524 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
P18524 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
P18524 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
P18524 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
P18524 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
P18524 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
P18524 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
P18524 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
P18524 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
P18524 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
P18524 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
P18524 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
P18524 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
P18524 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
P18524 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
P18524 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
P18524 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
P18524 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
P18524 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
P18524 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
P18524 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
P18524 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
P18524 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
P18524 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
P18524 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
P18524 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
P18524 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
P18524 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
P18524 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
P18524 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
P18524 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
P18524 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
P18524 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
P18524 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
P18524 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
P18524 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
P18524 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
P18524 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
P18524 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
P18524 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
P18524 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P18524 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P18524 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P18524 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P18524 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P18524 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P18524 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P18524 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P18524 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P18524 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P18524 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P18524 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
P18524 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
P18524 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
P18524 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P18524 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
P18524 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
P18524 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
P18524 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P18524 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
P18524 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P18524 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
P18524 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
P18524 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P18524 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P18524 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P18524 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
P18524 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P18524 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P18524 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
P18524 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P18524 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P18524 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms