Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

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Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxb1P17919 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxb1P17919 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxb1P17919 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxb1P17919 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxb1P17919 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxb1P17919 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxb1P17919 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxb1P17919 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxb1P17919 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxb1P17919 Gm45609-206ENSMUST00000210176 1023 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxb1P17919 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxb1P17919 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxb1P17919 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxb1P17919 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxb1P17919 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxb1P17919 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxb1P17919 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxb1P17919 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxb1P17919 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxb1P17919 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxb1P17919 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxb1P17919 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxb1P17919 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxb1P17919 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxb1P17919 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxb1P17919 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxb1P17919 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxb1P17919 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxb1P17919 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hoxb1P17919 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hoxb1P17919 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hoxb1P17919 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hoxb1P17919 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hoxb1P17919 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hoxb1P17919 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hoxb1P17919 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hoxb1P17919 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hoxb1P17919 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hoxb1P17919 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hoxb1P17919 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hoxb1P17919 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hoxb1P17919 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hoxb1P17919 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hoxb1P17919 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Hoxb1P17919 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hoxb1P17919 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hoxb1P17919 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hoxb1P17919 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hoxb1P17919 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hoxb1P17919 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hoxb1P17919 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hoxb1P17919 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hoxb1P17919 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Hoxb1P17919 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hoxb1P17919 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hoxb1P17919 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hoxb1P17919 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hoxb1P17919 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hoxb1P17919 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hoxb1P17919 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hoxb1P17919 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hoxb1P17919 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hoxb1P17919 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hoxb1P17919 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hoxb1P17919 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hoxb1P17919 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hoxb1P17919 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hoxb1P17919 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hoxb1P17919 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hoxb1P17919 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hoxb1P17919 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxb1P17919 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxb1P17919 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxb1P17919 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxb1P17919 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxb1P17919 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxb1P17919 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxb1P17919 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxb1P17919 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxb1P17919 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxb1P17919 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxb1P17919 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxb1P17919 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxb1P17919 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxb1P17919 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxb1P17919 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxb1P17919 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxb1P17919 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxb1P17919 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxb1P17919 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxb1P17919 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxb1P17919 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxb1P17919 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxb1P17919 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxb1P17919 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxb1P17919 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxb1P17919 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxb1P17919 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxb1P17919 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
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