Protein–RNA interactions for Protein: P15379

Cd44, CD44 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd44P15379 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd44P15379 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd44P15379 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd44P15379 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd44P15379 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd44P15379 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd44P15379 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd44P15379 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd44P15379 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd44P15379 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd44P15379 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cd44P15379 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cd44P15379 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cd44P15379 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cd44P15379 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cd44P15379 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cd44P15379 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cd44P15379 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cd44P15379 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cd44P15379 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cd44P15379 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cd44P15379 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cd44P15379 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cd44P15379 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cd44P15379 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cd44P15379 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cd44P15379 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cd44P15379 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cd44P15379 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cd44P15379 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cd44P15379 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cd44P15379 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cd44P15379 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cd44P15379 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cd44P15379 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cd44P15379 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cd44P15379 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cd44P15379 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cd44P15379 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cd44P15379 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cd44P15379 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cd44P15379 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cd44P15379 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cd44P15379 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cd44P15379 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cd44P15379 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cd44P15379 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cd44P15379 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cd44P15379 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cd44P15379 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cd44P15379 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cd44P15379 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cd44P15379 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cd44P15379 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cd44P15379 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cd44P15379 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cd44P15379 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cd44P15379 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cd44P15379 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cd44P15379 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cd44P15379 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cd44P15379 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cd44P15379 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cd44P15379 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cd44P15379 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cd44P15379 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cd44P15379 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cd44P15379 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cd44P15379 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cd44P15379 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cd44P15379 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cd44P15379 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cd44P15379 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cd44P15379 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cd44P15379 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cd44P15379 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cd44P15379 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cd44P15379 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cd44P15379 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cd44P15379 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cd44P15379 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cd44P15379 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cd44P15379 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cd44P15379 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cd44P15379 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cd44P15379 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cd44P15379 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cd44P15379 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cd44P15379 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cd44P15379 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd44P15379 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd44P15379 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd44P15379 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd44P15379 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd44P15379 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd44P15379 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd44P15379 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd44P15379 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd44P15379 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd44P15379 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.8 ms