Protein–RNA interactions for Protein: P15331

Prph, Peripherin, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrphP15331 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PrphP15331 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PrphP15331 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PrphP15331 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PrphP15331 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PrphP15331 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PrphP15331 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PrphP15331 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PrphP15331 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PrphP15331 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PrphP15331 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PrphP15331 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PrphP15331 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PrphP15331 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PrphP15331 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PrphP15331 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PrphP15331 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PrphP15331 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PrphP15331 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PrphP15331 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PrphP15331 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PrphP15331 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PrphP15331 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PrphP15331 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PrphP15331 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PrphP15331 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PrphP15331 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PrphP15331 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PrphP15331 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PrphP15331 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PrphP15331 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PrphP15331 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PrphP15331 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PrphP15331 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PrphP15331 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PrphP15331 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PrphP15331 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PrphP15331 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PrphP15331 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PrphP15331 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PrphP15331 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PrphP15331 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PrphP15331 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PrphP15331 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PrphP15331 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PrphP15331 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PrphP15331 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PrphP15331 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PrphP15331 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PrphP15331 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PrphP15331 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PrphP15331 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PrphP15331 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PrphP15331 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PrphP15331 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PrphP15331 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PrphP15331 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PrphP15331 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PrphP15331 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PrphP15331 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PrphP15331 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PrphP15331 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PrphP15331 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PrphP15331 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PrphP15331 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PrphP15331 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PrphP15331 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PrphP15331 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PrphP15331 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PrphP15331 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PrphP15331 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PrphP15331 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PrphP15331 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PrphP15331 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PrphP15331 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PrphP15331 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
PrphP15331 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
PrphP15331 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
PrphP15331 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PrphP15331 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PrphP15331 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PrphP15331 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PrphP15331 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PrphP15331 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PrphP15331 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PrphP15331 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PrphP15331 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PrphP15331 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PrphP15331 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PrphP15331 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PrphP15331 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PrphP15331 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PrphP15331 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PrphP15331 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PrphP15331 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PrphP15331 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PrphP15331 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PrphP15331 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PrphP15331 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PrphP15331 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms