Protein–RNA interactions for Protein: P15314

Irf1, Interferon regulatory factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf1P15314 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Irf1P15314 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Irf1P15314 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Irf1P15314 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Irf1P15314 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Irf1P15314 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Irf1P15314 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Irf1P15314 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Irf1P15314 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Irf1P15314 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Irf1P15314 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Irf1P15314 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Irf1P15314 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Irf1P15314 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Irf1P15314 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Irf1P15314 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Irf1P15314 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Irf1P15314 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Irf1P15314 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Irf1P15314 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Irf1P15314 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Irf1P15314 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Irf1P15314 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Irf1P15314 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Irf1P15314 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Irf1P15314 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Irf1P15314 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Irf1P15314 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Irf1P15314 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Irf1P15314 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Irf1P15314 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Irf1P15314 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Irf1P15314 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Irf1P15314 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Irf1P15314 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Irf1P15314 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Irf1P15314 Gm43936-201ENSMUST00000203987 490 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Irf1P15314 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Irf1P15314 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Irf1P15314 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Irf1P15314 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Irf1P15314 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Irf1P15314 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Irf1P15314 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Irf1P15314 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Irf1P15314 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Irf1P15314 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Irf1P15314 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Irf1P15314 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Irf1P15314 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Irf1P15314 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Irf1P15314 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Irf1P15314 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Irf1P15314 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Irf1P15314 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Irf1P15314 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Irf1P15314 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Irf1P15314 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Irf1P15314 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Irf1P15314 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Irf1P15314 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Irf1P15314 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Irf1P15314 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Irf1P15314 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Irf1P15314 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Irf1P15314 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Irf1P15314 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Irf1P15314 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Irf1P15314 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Irf1P15314 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Irf1P15314 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Irf1P15314 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Irf1P15314 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Irf1P15314 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Irf1P15314 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Irf1P15314 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Irf1P15314 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Irf1P15314 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Irf1P15314 Gm43930-201ENSMUST00000203868 845 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Irf1P15314 Gm32390-201ENSMUST00000212713 1172 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Irf1P15314 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Irf1P15314 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Irf1P15314 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Irf1P15314 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Irf1P15314 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Irf1P15314 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Irf1P15314 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Irf1P15314 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Irf1P15314 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Irf1P15314 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Irf1P15314 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Irf1P15314 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Irf1P15314 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Irf1P15314 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Irf1P15314 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Irf1P15314 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Irf1P15314 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Irf1P15314 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Irf1P15314 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Irf1P15314 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms