Protein–RNA interactions for Protein: P14733

Lmnb1, Lamin-B1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmnb1P14733 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lmnb1P14733 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lmnb1P14733 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lmnb1P14733 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lmnb1P14733 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lmnb1P14733 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lmnb1P14733 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lmnb1P14733 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lmnb1P14733 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lmnb1P14733 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lmnb1P14733 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lmnb1P14733 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lmnb1P14733 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lmnb1P14733 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lmnb1P14733 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lmnb1P14733 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lmnb1P14733 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lmnb1P14733 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lmnb1P14733 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lmnb1P14733 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lmnb1P14733 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lmnb1P14733 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lmnb1P14733 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lmnb1P14733 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lmnb1P14733 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lmnb1P14733 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lmnb1P14733 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Lmnb1P14733 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lmnb1P14733 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lmnb1P14733 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lmnb1P14733 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lmnb1P14733 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lmnb1P14733 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lmnb1P14733 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lmnb1P14733 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lmnb1P14733 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lmnb1P14733 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lmnb1P14733 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lmnb1P14733 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lmnb1P14733 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Lmnb1P14733 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lmnb1P14733 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lmnb1P14733 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lmnb1P14733 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lmnb1P14733 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lmnb1P14733 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lmnb1P14733 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lmnb1P14733 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lmnb1P14733 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Lmnb1P14733 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Lmnb1P14733 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lmnb1P14733 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lmnb1P14733 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lmnb1P14733 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lmnb1P14733 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lmnb1P14733 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lmnb1P14733 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lmnb1P14733 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lmnb1P14733 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lmnb1P14733 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Lmnb1P14733 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lmnb1P14733 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Lmnb1P14733 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lmnb1P14733 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lmnb1P14733 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Lmnb1P14733 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lmnb1P14733 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lmnb1P14733 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lmnb1P14733 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lmnb1P14733 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lmnb1P14733 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lmnb1P14733 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lmnb1P14733 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lmnb1P14733 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lmnb1P14733 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lmnb1P14733 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Lmnb1P14733 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lmnb1P14733 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lmnb1P14733 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lmnb1P14733 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lmnb1P14733 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lmnb1P14733 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lmnb1P14733 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lmnb1P14733 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lmnb1P14733 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lmnb1P14733 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Lmnb1P14733 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lmnb1P14733 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lmnb1P14733 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lmnb1P14733 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lmnb1P14733 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lmnb1P14733 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Lmnb1P14733 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lmnb1P14733 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lmnb1P14733 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Lmnb1P14733 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lmnb1P14733 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lmnb1P14733 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lmnb1P14733 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lmnb1P14733 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms