Protein–RNA interactions for Protein: P14097

Ccl4, C-C motif chemokine 4, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl4P14097 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccl4P14097 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccl4P14097 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccl4P14097 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccl4P14097 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccl4P14097 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccl4P14097 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccl4P14097 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccl4P14097 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccl4P14097 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccl4P14097 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccl4P14097 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccl4P14097 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccl4P14097 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccl4P14097 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccl4P14097 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccl4P14097 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccl4P14097 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccl4P14097 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccl4P14097 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccl4P14097 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ccl4P14097 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ccl4P14097 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccl4P14097 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccl4P14097 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccl4P14097 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccl4P14097 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccl4P14097 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccl4P14097 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccl4P14097 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccl4P14097 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccl4P14097 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccl4P14097 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccl4P14097 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccl4P14097 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccl4P14097 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccl4P14097 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccl4P14097 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccl4P14097 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccl4P14097 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccl4P14097 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccl4P14097 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccl4P14097 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccl4P14097 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccl4P14097 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccl4P14097 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccl4P14097 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccl4P14097 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccl4P14097 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccl4P14097 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccl4P14097 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccl4P14097 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccl4P14097 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccl4P14097 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccl4P14097 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccl4P14097 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccl4P14097 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccl4P14097 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccl4P14097 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ccl4P14097 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccl4P14097 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccl4P14097 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccl4P14097 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccl4P14097 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccl4P14097 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccl4P14097 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccl4P14097 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccl4P14097 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccl4P14097 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccl4P14097 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccl4P14097 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccl4P14097 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccl4P14097 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccl4P14097 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccl4P14097 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccl4P14097 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccl4P14097 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccl4P14097 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ccl4P14097 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccl4P14097 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccl4P14097 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccl4P14097 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccl4P14097 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccl4P14097 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccl4P14097 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ccl4P14097 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ccl4P14097 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccl4P14097 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccl4P14097 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Ccl4P14097 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ccl4P14097 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Ccl4P14097 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccl4P14097 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccl4P14097 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccl4P14097 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccl4P14097 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccl4P14097 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccl4P14097 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccl4P14097 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccl4P14097 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms