Protein–RNA interactions for Protein: P13609

Srgn, Serglycin, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrgnP13609 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SrgnP13609 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SrgnP13609 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SrgnP13609 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SrgnP13609 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SrgnP13609 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SrgnP13609 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SrgnP13609 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SrgnP13609 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SrgnP13609 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SrgnP13609 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SrgnP13609 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SrgnP13609 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SrgnP13609 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SrgnP13609 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SrgnP13609 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SrgnP13609 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SrgnP13609 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SrgnP13609 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SrgnP13609 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SrgnP13609 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SrgnP13609 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SrgnP13609 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SrgnP13609 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SrgnP13609 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SrgnP13609 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SrgnP13609 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SrgnP13609 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SrgnP13609 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SrgnP13609 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SrgnP13609 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SrgnP13609 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SrgnP13609 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SrgnP13609 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SrgnP13609 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SrgnP13609 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SrgnP13609 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SrgnP13609 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SrgnP13609 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SrgnP13609 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SrgnP13609 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SrgnP13609 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SrgnP13609 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SrgnP13609 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SrgnP13609 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SrgnP13609 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SrgnP13609 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SrgnP13609 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SrgnP13609 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SrgnP13609 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SrgnP13609 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SrgnP13609 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SrgnP13609 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SrgnP13609 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SrgnP13609 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SrgnP13609 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SrgnP13609 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SrgnP13609 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SrgnP13609 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SrgnP13609 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SrgnP13609 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SrgnP13609 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SrgnP13609 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SrgnP13609 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SrgnP13609 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SrgnP13609 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SrgnP13609 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SrgnP13609 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SrgnP13609 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SrgnP13609 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SrgnP13609 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SrgnP13609 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SrgnP13609 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SrgnP13609 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SrgnP13609 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SrgnP13609 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SrgnP13609 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SrgnP13609 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SrgnP13609 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SrgnP13609 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SrgnP13609 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SrgnP13609 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SrgnP13609 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SrgnP13609 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SrgnP13609 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SrgnP13609 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SrgnP13609 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SrgnP13609 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SrgnP13609 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SrgnP13609 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SrgnP13609 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SrgnP13609 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SrgnP13609 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SrgnP13609 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SrgnP13609 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SrgnP13609 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SrgnP13609 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SrgnP13609 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SrgnP13609 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SrgnP13609 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms