Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms