Protein–RNA interactions for Protein: P10856

Tnp1, Spermatid nuclear transition protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 55 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnp1P10856 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Tnp1P10856 Myt1l-201ENSMUST00000021009 5027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Tnp1P10856 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Tnp1P10856 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Tnp1P10856 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Tnp1P10856 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Tnp1P10856 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Tnp1P10856 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Tnp1P10856 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Tnp1P10856 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Tnp1P10856 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Tnp1P10856 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Tnp1P10856 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Tnp1P10856 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Tnp1P10856 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Tnp1P10856 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Tnp1P10856 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Tnp1P10856 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Tnp1P10856 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Tnp1P10856 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Tnp1P10856 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Tnp1P10856 Cep250-204ENSMUST00000109619 7977 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Tnp1P10856 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Tnp1P10856 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Tnp1P10856 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Tnp1P10856 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Tnp1P10856 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Tnp1P10856 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Tnp1P10856 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Tnp1P10856 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Tnp1P10856 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Tnp1P10856 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Tnp1P10856 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Tnp1P10856 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Tnp1P10856 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Tnp1P10856 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Tnp1P10856 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Tnp1P10856 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Tnp1P10856 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Tnp1P10856 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Tnp1P10856 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Tnp1P10856 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Tnp1P10856 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Tnp1P10856 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Tnp1P10856 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Tnp1P10856 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Tnp1P10856 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Tnp1P10856 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Tnp1P10856 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Tnp1P10856 Enam-201ENSMUST00000031222 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Tnp1P10856 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Tnp1P10856 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Tnp1P10856 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Tnp1P10856 Ankrd52-201ENSMUST00000014642 6620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Tnp1P10856 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Tnp1P10856 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Tnp1P10856 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Tnp1P10856 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Tnp1P10856 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Tnp1P10856 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Tnp1P10856 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Tnp1P10856 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Tnp1P10856 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Tnp1P10856 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Tnp1P10856 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Tnp1P10856 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Tnp1P10856 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Tnp1P10856 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Tnp1P10856 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Tnp1P10856 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Tnp1P10856 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Tnp1P10856 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Tnp1P10856 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Tnp1P10856 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Tnp1P10856 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Tnp1P10856 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Tnp1P10856 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Tnp1P10856 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Tnp1P10856 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Tnp1P10856 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Tnp1P10856 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Tnp1P10856 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Tnp1P10856 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Tnp1P10856 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Tnp1P10856 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Tnp1P10856 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Tnp1P10856 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Tnp1P10856 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Tnp1P10856 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Tnp1P10856 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Tnp1P10856 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Tnp1P10856 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Tnp1P10856 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Tnp1P10856 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Tnp1P10856 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Tnp1P10856 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Tnp1P10856 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Tnp1P10856 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Tnp1P10856 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Tnp1P10856 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms