Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
P10404 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P10404 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P10404 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
P10404 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P10404 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P10404 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P10404 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P10404 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P10404 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P10404 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
P10404 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P10404 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
P10404 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
P10404 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P10404 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
P10404 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P10404 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
P10404 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
P10404 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
P10404 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P10404 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
P10404 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
P10404 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P10404 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
P10404 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
P10404 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P10404 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
P10404 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P10404 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
P10404 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P10404 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P10404 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P10404 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P10404 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
P10404 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
P10404 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
P10404 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
P10404 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P10404 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
P10404 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
P10404 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P10404 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P10404 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P10404 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
P10404 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P10404 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P10404 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P10404 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P10404 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P10404 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P10404 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
P10404 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P10404 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P10404 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
P10404 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P10404 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P10404 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
P10404 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P10404 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P10404 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P10404 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P10404 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
P10404 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P10404 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
P10404 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P10404 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
P10404 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
P10404 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P10404 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P10404 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
P10404 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P10404 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.83□□□□□ -0.35
P10404 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
P10404 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.35
P10404 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
P10404 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
P10404 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
P10404 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
P10404 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
P10404 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
P10404 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
P10404 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
P10404 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
P10404 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
P10404 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
P10404 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
P10404 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
P10404 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
P10404 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
P10404 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
P10404 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
P10404 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
P10404 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
P10404 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
P10404 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
P10404 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
P10404 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
P10404 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
P10404 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
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