Protein–RNA interactions for Protein: P10284

Hoxb4, Homeobox protein Hox-B4, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb4P10284 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxb4P10284 Gm5169-201ENSMUST00000096469 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxb4P10284 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxb4P10284 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxb4P10284 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hoxb4P10284 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hoxb4P10284 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hoxb4P10284 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hoxb4P10284 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxb4P10284 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxb4P10284 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxb4P10284 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxb4P10284 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxb4P10284 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxb4P10284 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxb4P10284 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxb4P10284 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxb4P10284 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxb4P10284 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxb4P10284 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxb4P10284 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxb4P10284 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxb4P10284 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxb4P10284 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxb4P10284 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxb4P10284 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxb4P10284 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxb4P10284 Gm28722-201ENSMUST00000187630 1036 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxb4P10284 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxb4P10284 Gm29747-201ENSMUST00000194764 585 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxb4P10284 Gm43244-201ENSMUST00000196994 1285 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxb4P10284 Gm6649-201ENSMUST00000199743 1165 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxb4P10284 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxb4P10284 Pafah1b1-ps2-201ENSMUST00000207209 1223 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxb4P10284 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxb4P10284 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxb4P10284 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxb4P10284 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxb4P10284 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxb4P10284 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxb4P10284 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxb4P10284 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxb4P10284 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxb4P10284 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxb4P10284 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxb4P10284 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxb4P10284 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxb4P10284 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxb4P10284 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxb4P10284 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxb4P10284 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxb4P10284 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxb4P10284 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxb4P10284 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxb4P10284 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxb4P10284 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxb4P10284 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxb4P10284 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxb4P10284 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxb4P10284 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxb4P10284 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxb4P10284 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxb4P10284 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxb4P10284 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxb4P10284 Rbm48-202ENSMUST00000121877 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxb4P10284 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxb4P10284 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxb4P10284 Gm28923-201ENSMUST00000187755 322 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxb4P10284 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxb4P10284 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxb4P10284 Gm32296-201ENSMUST00000220590 1057 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxb4P10284 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxb4P10284 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxb4P10284 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxb4P10284 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxb4P10284 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxb4P10284 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxb4P10284 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxb4P10284 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxb4P10284 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxb4P10284 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxb4P10284 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxb4P10284 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxb4P10284 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxb4P10284 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxb4P10284 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxb4P10284 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxb4P10284 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxb4P10284 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxb4P10284 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxb4P10284 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxb4P10284 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxb4P10284 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxb4P10284 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxb4P10284 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxb4P10284 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxb4P10284 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxb4P10284 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxb4P10284 4933405E24Rik-201ENSMUST00000131019 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxb4P10284 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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