Protein–RNA interactions for Protein: P10085

Myod1, Myoblast determination protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myod1P10085 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Myod1P10085 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Myod1P10085 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Myod1P10085 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Myod1P10085 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Myod1P10085 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Myod1P10085 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Myod1P10085 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Myod1P10085 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Myod1P10085 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Myod1P10085 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Myod1P10085 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Myod1P10085 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Myod1P10085 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Myod1P10085 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Myod1P10085 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Myod1P10085 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Myod1P10085 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Myod1P10085 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Myod1P10085 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Myod1P10085 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Myod1P10085 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Myod1P10085 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Myod1P10085 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Myod1P10085 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Myod1P10085 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Myod1P10085 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Myod1P10085 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Myod1P10085 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Myod1P10085 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Myod1P10085 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Myod1P10085 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Myod1P10085 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Myod1P10085 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Myod1P10085 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Myod1P10085 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Myod1P10085 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Myod1P10085 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Myod1P10085 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Myod1P10085 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Myod1P10085 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Myod1P10085 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Myod1P10085 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Myod1P10085 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Myod1P10085 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Myod1P10085 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Myod1P10085 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Myod1P10085 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Myod1P10085 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Myod1P10085 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Myod1P10085 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Myod1P10085 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Myod1P10085 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Myod1P10085 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Myod1P10085 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Myod1P10085 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Myod1P10085 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Myod1P10085 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Myod1P10085 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Myod1P10085 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Myod1P10085 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Myod1P10085 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Myod1P10085 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Myod1P10085 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Myod1P10085 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Myod1P10085 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Myod1P10085 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Myod1P10085 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Myod1P10085 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Myod1P10085 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Myod1P10085 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Myod1P10085 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Myod1P10085 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Myod1P10085 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Myod1P10085 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Myod1P10085 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Myod1P10085 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Myod1P10085 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Myod1P10085 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Myod1P10085 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Myod1P10085 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Myod1P10085 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Myod1P10085 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Myod1P10085 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Myod1P10085 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Myod1P10085 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Myod1P10085 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Myod1P10085 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Myod1P10085 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Myod1P10085 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Myod1P10085 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Myod1P10085 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Myod1P10085 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Myod1P10085 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Myod1P10085 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Myod1P10085 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Myod1P10085 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Myod1P10085 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Myod1P10085 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Myod1P10085 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.2 ms