Protein–RNA interactions for Protein: P0DP28

Calm3, Calmodulin-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 149 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calm3P0DP28 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Calm3P0DP28 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Calm3P0DP28 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Calm3P0DP28 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Calm3P0DP28 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Calm3P0DP28 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Calm3P0DP28 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Calm3P0DP28 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Calm3P0DP28 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Calm3P0DP28 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Calm3P0DP28 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Calm3P0DP28 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Calm3P0DP28 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Calm3P0DP28 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Calm3P0DP28 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Calm3P0DP28 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Calm3P0DP28 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Calm3P0DP28 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Calm3P0DP28 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Calm3P0DP28 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Calm3P0DP28 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Calm3P0DP28 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Calm3P0DP28 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Calm3P0DP28 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Calm3P0DP28 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Calm3P0DP28 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Calm3P0DP28 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Calm3P0DP28 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Calm3P0DP28 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Calm3P0DP28 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Calm3P0DP28 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Calm3P0DP28 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Calm3P0DP28 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Calm3P0DP28 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Calm3P0DP28 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Calm3P0DP28 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Calm3P0DP28 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Calm3P0DP28 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Calm3P0DP28 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Calm3P0DP28 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Calm3P0DP28 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Calm3P0DP28 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Calm3P0DP28 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Calm3P0DP28 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Calm3P0DP28 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Calm3P0DP28 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Calm3P0DP28 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Calm3P0DP28 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Calm3P0DP28 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Calm3P0DP28 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Calm3P0DP28 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Calm3P0DP28 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Calm3P0DP28 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Calm3P0DP28 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Calm3P0DP28 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Calm3P0DP28 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Calm3P0DP28 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Calm3P0DP28 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Calm3P0DP28 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Calm3P0DP28 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Calm3P0DP28 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Calm3P0DP28 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Calm3P0DP28 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Calm3P0DP28 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Calm3P0DP28 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Calm3P0DP28 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Calm3P0DP28 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Calm3P0DP28 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Calm3P0DP28 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Calm3P0DP28 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Calm3P0DP28 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Calm3P0DP28 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Calm3P0DP28 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Calm3P0DP28 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Calm3P0DP28 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Calm3P0DP28 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Calm3P0DP28 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Calm3P0DP28 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Calm3P0DP28 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Calm3P0DP28 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Calm3P0DP28 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Calm3P0DP28 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Calm3P0DP28 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Calm3P0DP28 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Calm3P0DP28 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Calm3P0DP28 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Calm3P0DP28 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Calm3P0DP28 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Calm3P0DP28 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Calm3P0DP28 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Calm3P0DP28 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Calm3P0DP28 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Calm3P0DP28 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Calm3P0DP28 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Calm3P0DP28 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Calm3P0DP28 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Calm3P0DP28 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Calm3P0DP28 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Calm3P0DP28 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Calm3P0DP28 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.6 ms