Protein–RNA interactions for Protein: P0C5K0

Sbk3, Uncharacterized serine/threonine-protein kinase SBK3, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbk3P0C5K0 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sbk3P0C5K0 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sbk3P0C5K0 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sbk3P0C5K0 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sbk3P0C5K0 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sbk3P0C5K0 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sbk3P0C5K0 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sbk3P0C5K0 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sbk3P0C5K0 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sbk3P0C5K0 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sbk3P0C5K0 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sbk3P0C5K0 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sbk3P0C5K0 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sbk3P0C5K0 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sbk3P0C5K0 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sbk3P0C5K0 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sbk3P0C5K0 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sbk3P0C5K0 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sbk3P0C5K0 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sbk3P0C5K0 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sbk3P0C5K0 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Sbk3P0C5K0 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sbk3P0C5K0 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
Sbk3P0C5K0 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sbk3P0C5K0 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Sbk3P0C5K0 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sbk3P0C5K0 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sbk3P0C5K0 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sbk3P0C5K0 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sbk3P0C5K0 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sbk3P0C5K0 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sbk3P0C5K0 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sbk3P0C5K0 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sbk3P0C5K0 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sbk3P0C5K0 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Sbk3P0C5K0 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Sbk3P0C5K0 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Sbk3P0C5K0 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sbk3P0C5K0 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sbk3P0C5K0 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sbk3P0C5K0 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sbk3P0C5K0 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sbk3P0C5K0 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sbk3P0C5K0 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sbk3P0C5K0 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sbk3P0C5K0 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sbk3P0C5K0 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Sbk3P0C5K0 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sbk3P0C5K0 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sbk3P0C5K0 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sbk3P0C5K0 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sbk3P0C5K0 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Sbk3P0C5K0 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sbk3P0C5K0 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sbk3P0C5K0 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Sbk3P0C5K0 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sbk3P0C5K0 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sbk3P0C5K0 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sbk3P0C5K0 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Sbk3P0C5K0 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sbk3P0C5K0 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sbk3P0C5K0 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sbk3P0C5K0 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sbk3P0C5K0 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sbk3P0C5K0 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Sbk3P0C5K0 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Sbk3P0C5K0 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sbk3P0C5K0 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Sbk3P0C5K0 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Sbk3P0C5K0 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sbk3P0C5K0 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sbk3P0C5K0 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Sbk3P0C5K0 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sbk3P0C5K0 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sbk3P0C5K0 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sbk3P0C5K0 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sbk3P0C5K0 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sbk3P0C5K0 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sbk3P0C5K0 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Sbk3P0C5K0 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sbk3P0C5K0 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sbk3P0C5K0 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sbk3P0C5K0 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sbk3P0C5K0 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sbk3P0C5K0 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sbk3P0C5K0 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sbk3P0C5K0 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sbk3P0C5K0 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sbk3P0C5K0 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sbk3P0C5K0 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sbk3P0C5K0 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Sbk3P0C5K0 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sbk3P0C5K0 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Sbk3P0C5K0 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sbk3P0C5K0 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sbk3P0C5K0 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sbk3P0C5K0 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Sbk3P0C5K0 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sbk3P0C5K0 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Sbk3P0C5K0 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.2 ms