Protein–RNA interactions for Protein: P09021

Hoxa5, Homeobox protein Hox-A5, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa5P09021 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxa5P09021 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxa5P09021 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxa5P09021 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxa5P09021 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxa5P09021 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxa5P09021 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxa5P09021 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxa5P09021 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxa5P09021 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxa5P09021 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxa5P09021 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxa5P09021 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxa5P09021 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxa5P09021 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxa5P09021 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxa5P09021 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxa5P09021 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxa5P09021 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxa5P09021 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxa5P09021 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxa5P09021 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxa5P09021 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxa5P09021 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxa5P09021 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxa5P09021 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxa5P09021 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxa5P09021 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxa5P09021 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxa5P09021 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxa5P09021 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxa5P09021 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxa5P09021 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxa5P09021 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxa5P09021 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxa5P09021 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxa5P09021 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxa5P09021 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxa5P09021 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxa5P09021 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxa5P09021 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxa5P09021 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxa5P09021 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxa5P09021 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxa5P09021 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxa5P09021 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxa5P09021 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxa5P09021 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxa5P09021 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxa5P09021 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxa5P09021 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxa5P09021 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxa5P09021 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxa5P09021 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxa5P09021 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxa5P09021 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxa5P09021 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxa5P09021 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxa5P09021 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxa5P09021 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxa5P09021 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxa5P09021 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxa5P09021 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxa5P09021 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxa5P09021 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxa5P09021 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxa5P09021 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxa5P09021 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxa5P09021 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxa5P09021 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxa5P09021 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxa5P09021 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxa5P09021 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxa5P09021 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxa5P09021 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxa5P09021 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxa5P09021 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxa5P09021 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxa5P09021 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxa5P09021 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxa5P09021 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxa5P09021 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxa5P09021 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxa5P09021 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxa5P09021 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxa5P09021 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxa5P09021 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxa5P09021 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxa5P09021 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxa5P09021 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxa5P09021 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxa5P09021 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxa5P09021 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxa5P09021 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxa5P09021 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxa5P09021 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxa5P09021 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxa5P09021 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxa5P09021 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxa5P09021 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms