Protein–RNA interactions for Protein: P06798

Hoxa4, Homeobox protein Hox-A4, mousemouse

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Length 285 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa4P06798 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hoxa4P06798 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hoxa4P06798 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hoxa4P06798 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxa4P06798 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxa4P06798 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxa4P06798 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxa4P06798 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxa4P06798 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxa4P06798 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxa4P06798 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxa4P06798 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxa4P06798 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxa4P06798 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxa4P06798 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxa4P06798 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxa4P06798 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxa4P06798 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxa4P06798 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxa4P06798 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxa4P06798 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxa4P06798 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxa4P06798 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxa4P06798 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxa4P06798 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxa4P06798 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxa4P06798 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxa4P06798 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxa4P06798 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxa4P06798 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxa4P06798 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxa4P06798 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxa4P06798 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxa4P06798 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxa4P06798 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxa4P06798 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxa4P06798 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxa4P06798 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxa4P06798 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxa4P06798 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxa4P06798 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxa4P06798 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxa4P06798 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxa4P06798 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxa4P06798 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxa4P06798 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxa4P06798 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxa4P06798 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxa4P06798 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxa4P06798 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxa4P06798 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxa4P06798 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxa4P06798 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxa4P06798 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxa4P06798 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxa4P06798 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxa4P06798 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxa4P06798 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxa4P06798 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxa4P06798 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxa4P06798 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxa4P06798 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxa4P06798 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxa4P06798 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxa4P06798 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxa4P06798 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxa4P06798 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxa4P06798 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxa4P06798 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxa4P06798 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxa4P06798 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxa4P06798 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxa4P06798 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxa4P06798 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxa4P06798 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxa4P06798 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxa4P06798 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxa4P06798 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxa4P06798 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxa4P06798 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxa4P06798 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxa4P06798 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxa4P06798 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxa4P06798 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxa4P06798 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxa4P06798 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxa4P06798 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxa4P06798 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxa4P06798 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxa4P06798 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxa4P06798 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxa4P06798 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxa4P06798 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxa4P06798 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxa4P06798 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxa4P06798 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxa4P06798 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxa4P06798 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxa4P06798 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxa4P06798 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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