Protein–RNA interactions for Protein: P02535

Krt10, Keratin, type I cytoskeletal 10, mousemouse

Predictions only

Length 570 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt10P02535 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt10P02535 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt10P02535 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt10P02535 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt10P02535 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt10P02535 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt10P02535 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt10P02535 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt10P02535 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt10P02535 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt10P02535 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt10P02535 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt10P02535 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt10P02535 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt10P02535 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt10P02535 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt10P02535 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt10P02535 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt10P02535 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt10P02535 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt10P02535 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt10P02535 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt10P02535 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt10P02535 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt10P02535 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt10P02535 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt10P02535 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt10P02535 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt10P02535 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt10P02535 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt10P02535 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt10P02535 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt10P02535 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt10P02535 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt10P02535 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt10P02535 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt10P02535 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt10P02535 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt10P02535 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt10P02535 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt10P02535 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt10P02535 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt10P02535 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt10P02535 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt10P02535 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt10P02535 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt10P02535 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt10P02535 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt10P02535 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt10P02535 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt10P02535 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt10P02535 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt10P02535 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt10P02535 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt10P02535 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt10P02535 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt10P02535 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt10P02535 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt10P02535 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt10P02535 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt10P02535 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt10P02535 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt10P02535 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt10P02535 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt10P02535 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt10P02535 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt10P02535 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt10P02535 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt10P02535 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt10P02535 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt10P02535 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt10P02535 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt10P02535 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt10P02535 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt10P02535 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt10P02535 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt10P02535 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt10P02535 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt10P02535 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt10P02535 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt10P02535 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt10P02535 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt10P02535 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt10P02535 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt10P02535 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt10P02535 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt10P02535 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt10P02535 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt10P02535 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Krt10P02535 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Krt10P02535 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Krt10P02535 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Krt10P02535 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Krt10P02535 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Krt10P02535 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Krt10P02535 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Krt10P02535 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Krt10P02535 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Krt10P02535 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Krt10P02535 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms