Protein–RNA interactions for Protein: P01667

Ig kappa chain V-III region PC 6308, mousemouse

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Length 111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01667 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
P01667 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
P01667 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
P01667 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
P01667 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
P01667 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
P01667 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
P01667 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
P01667 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
P01667 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
P01667 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
P01667 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
P01667 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
P01667 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
P01667 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
P01667 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
P01667 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
P01667 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
P01667 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
P01667 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
P01667 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
P01667 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
P01667 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
P01667 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
P01667 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
P01667 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
P01667 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
P01667 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
P01667 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
P01667 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
P01667 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
P01667 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
P01667 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
P01667 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
P01667 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
P01667 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
P01667 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
P01667 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
P01667 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
P01667 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
P01667 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
P01667 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
P01667 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
P01667 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
P01667 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
P01667 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
P01667 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
P01667 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
P01667 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
P01667 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
P01667 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
P01667 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
P01667 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
P01667 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
P01667 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
P01667 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
P01667 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
P01667 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
P01667 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
P01667 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
P01667 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
P01667 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
P01667 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
P01667 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
P01667 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
P01667 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
P01667 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
P01667 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
P01667 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
P01667 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
P01667 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
P01667 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
P01667 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
P01667 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
P01667 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
P01667 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
P01667 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
P01667 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
P01667 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
P01667 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
P01667 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
P01667 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
P01667 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
P01667 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
P01667 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
P01667 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
P01667 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
P01667 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
P01667 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
P01667 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
P01667 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
P01667 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
P01667 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
P01667 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
P01667 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
P01667 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
P01667 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
P01667 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
P01667 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
P01667 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms