Protein–RNA interactions for Protein: P01653

Ig kappa chain V-V region W3082, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01653 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01653 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01653 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01653 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01653 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01653 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01653 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01653 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01653 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01653 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01653 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01653 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01653 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01653 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01653 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01653 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01653 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01653 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01653 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01653 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01653 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01653 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01653 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01653 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
P01653 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
P01653 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
P01653 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01653 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
P01653 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01653 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
P01653 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01653 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01653 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01653 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01653 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01653 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01653 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01653 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01653 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01653 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01653 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01653 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01653 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01653 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01653 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01653 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01653 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01653 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01653 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01653 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01653 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01653 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01653 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01653 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01653 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01653 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01653 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01653 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01653 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01653 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01653 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01653 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
P01653 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
P01653 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01653 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01653 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01653 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01653 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
P01653 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01653 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01653 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01653 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
P01653 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01653 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01653 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01653 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01653 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01653 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01653 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01653 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01653 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01653 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01653 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01653 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01653 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01653 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01653 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01653 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01653 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01653 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01653 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01653 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01653 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01653 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01653 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01653 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01653 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01653 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01653 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01653 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms