Protein–RNA interactions for Protein: P01641

Ig kappa chain V-V region MOPC 173B, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01641 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P01641 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P01641 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P01641 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P01641 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P01641 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P01641 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
P01641 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.02■□□□□ -0
P01641 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P01641 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P01641 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
P01641 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
P01641 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P01641 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P01641 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P01641 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P01641 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
P01641 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
P01641 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
P01641 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
P01641 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
P01641 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
P01641 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
P01641 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
P01641 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
P01641 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P01641 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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P01641 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P01641 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P01641 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P01641 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P01641 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P01641 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
P01641 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P01641 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P01641 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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P01641 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P01641 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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P01641 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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P01641 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P01641 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P01641 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P01641 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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P01641 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P01641 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P01641 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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P01641 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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P01641 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
P01641 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
P01641 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
P01641 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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P01641 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
P01641 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
P01641 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
P01641 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
P01641 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
P01641 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
P01641 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
P01641 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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