Protein–RNA interactions for Protein: O88703

Hcn2, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcn2O88703 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hcn2O88703 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hcn2O88703 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hcn2O88703 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hcn2O88703 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hcn2O88703 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hcn2O88703 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hcn2O88703 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hcn2O88703 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hcn2O88703 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hcn2O88703 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hcn2O88703 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hcn2O88703 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hcn2O88703 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hcn2O88703 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hcn2O88703 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hcn2O88703 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hcn2O88703 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hcn2O88703 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hcn2O88703 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hcn2O88703 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hcn2O88703 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hcn2O88703 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hcn2O88703 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hcn2O88703 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hcn2O88703 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hcn2O88703 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hcn2O88703 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hcn2O88703 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hcn2O88703 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Hcn2O88703 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hcn2O88703 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Hcn2O88703 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hcn2O88703 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hcn2O88703 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hcn2O88703 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hcn2O88703 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hcn2O88703 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hcn2O88703 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hcn2O88703 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hcn2O88703 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hcn2O88703 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hcn2O88703 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hcn2O88703 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hcn2O88703 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hcn2O88703 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hcn2O88703 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hcn2O88703 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hcn2O88703 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hcn2O88703 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hcn2O88703 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hcn2O88703 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hcn2O88703 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Hcn2O88703 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hcn2O88703 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hcn2O88703 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hcn2O88703 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hcn2O88703 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hcn2O88703 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hcn2O88703 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hcn2O88703 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hcn2O88703 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hcn2O88703 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hcn2O88703 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hcn2O88703 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hcn2O88703 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hcn2O88703 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hcn2O88703 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hcn2O88703 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hcn2O88703 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hcn2O88703 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hcn2O88703 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hcn2O88703 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Hcn2O88703 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hcn2O88703 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hcn2O88703 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hcn2O88703 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hcn2O88703 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hcn2O88703 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hcn2O88703 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hcn2O88703 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hcn2O88703 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hcn2O88703 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hcn2O88703 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hcn2O88703 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hcn2O88703 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hcn2O88703 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hcn2O88703 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hcn2O88703 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hcn2O88703 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hcn2O88703 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hcn2O88703 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hcn2O88703 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Hcn2O88703 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hcn2O88703 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hcn2O88703 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hcn2O88703 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Hcn2O88703 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hcn2O88703 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hcn2O88703 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms