Protein–RNA interactions for Protein: O88696

Clpp, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, mousemouse

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Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClppO88696 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ClppO88696 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ClppO88696 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ClppO88696 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ClppO88696 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ClppO88696 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ClppO88696 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ClppO88696 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
ClppO88696 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
ClppO88696 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
ClppO88696 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
ClppO88696 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
ClppO88696 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ClppO88696 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ClppO88696 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ClppO88696 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ClppO88696 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ClppO88696 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ClppO88696 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ClppO88696 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ClppO88696 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ClppO88696 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ClppO88696 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ClppO88696 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ClppO88696 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ClppO88696 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
ClppO88696 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ClppO88696 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ClppO88696 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ClppO88696 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ClppO88696 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
ClppO88696 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ClppO88696 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ClppO88696 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ClppO88696 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ClppO88696 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ClppO88696 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ClppO88696 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ClppO88696 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ClppO88696 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ClppO88696 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ClppO88696 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ClppO88696 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ClppO88696 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ClppO88696 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ClppO88696 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ClppO88696 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ClppO88696 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ClppO88696 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ClppO88696 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ClppO88696 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ClppO88696 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ClppO88696 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ClppO88696 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ClppO88696 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ClppO88696 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ClppO88696 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ClppO88696 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ClppO88696 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ClppO88696 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ClppO88696 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ClppO88696 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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ClppO88696 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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ClppO88696 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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ClppO88696 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ClppO88696 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ClppO88696 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ClppO88696 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ClppO88696 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ClppO88696 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
ClppO88696 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ClppO88696 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ClppO88696 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ClppO88696 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ClppO88696 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ClppO88696 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ClppO88696 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ClppO88696 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ClppO88696 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ClppO88696 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ClppO88696 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ClppO88696 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ClppO88696 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ClppO88696 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ClppO88696 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ClppO88696 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ClppO88696 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ClppO88696 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ClppO88696 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ClppO88696 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ClppO88696 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ClppO88696 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
ClppO88696 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ClppO88696 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
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