Protein–RNA interactions for Protein: O70435

Psma3, Proteasome subunit alpha type-3, mousemouse

Predictions only

Length 255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma3O70435 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Psma3O70435 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Psma3O70435 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psma3O70435 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psma3O70435 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psma3O70435 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psma3O70435 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psma3O70435 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psma3O70435 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psma3O70435 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psma3O70435 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psma3O70435 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psma3O70435 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psma3O70435 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psma3O70435 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psma3O70435 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psma3O70435 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psma3O70435 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psma3O70435 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psma3O70435 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Psma3O70435 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psma3O70435 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psma3O70435 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psma3O70435 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Psma3O70435 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psma3O70435 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psma3O70435 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psma3O70435 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psma3O70435 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psma3O70435 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psma3O70435 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psma3O70435 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psma3O70435 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psma3O70435 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psma3O70435 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psma3O70435 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psma3O70435 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psma3O70435 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psma3O70435 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psma3O70435 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psma3O70435 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psma3O70435 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psma3O70435 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psma3O70435 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Psma3O70435 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psma3O70435 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psma3O70435 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psma3O70435 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psma3O70435 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psma3O70435 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psma3O70435 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psma3O70435 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psma3O70435 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psma3O70435 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psma3O70435 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psma3O70435 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psma3O70435 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psma3O70435 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psma3O70435 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psma3O70435 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psma3O70435 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psma3O70435 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psma3O70435 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psma3O70435 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psma3O70435 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psma3O70435 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psma3O70435 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psma3O70435 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psma3O70435 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Psma3O70435 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psma3O70435 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Psma3O70435 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psma3O70435 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psma3O70435 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psma3O70435 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psma3O70435 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psma3O70435 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psma3O70435 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psma3O70435 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psma3O70435 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psma3O70435 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psma3O70435 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psma3O70435 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psma3O70435 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psma3O70435 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psma3O70435 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psma3O70435 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psma3O70435 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psma3O70435 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psma3O70435 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psma3O70435 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psma3O70435 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psma3O70435 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Psma3O70435 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psma3O70435 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psma3O70435 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psma3O70435 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psma3O70435 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psma3O70435 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psma3O70435 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms