Protein–RNA interactions for Protein: O70263

Lnx1, E3 ubiquitin-protein ligase LNX, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx1O70263 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lnx1O70263 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lnx1O70263 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lnx1O70263 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Lnx1O70263 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lnx1O70263 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Lnx1O70263 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lnx1O70263 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lnx1O70263 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lnx1O70263 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lnx1O70263 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lnx1O70263 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lnx1O70263 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lnx1O70263 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lnx1O70263 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lnx1O70263 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lnx1O70263 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lnx1O70263 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lnx1O70263 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lnx1O70263 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lnx1O70263 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lnx1O70263 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lnx1O70263 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lnx1O70263 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lnx1O70263 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lnx1O70263 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Lnx1O70263 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lnx1O70263 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lnx1O70263 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lnx1O70263 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lnx1O70263 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lnx1O70263 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lnx1O70263 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lnx1O70263 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lnx1O70263 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lnx1O70263 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lnx1O70263 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lnx1O70263 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lnx1O70263 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lnx1O70263 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lnx1O70263 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lnx1O70263 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lnx1O70263 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lnx1O70263 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lnx1O70263 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lnx1O70263 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lnx1O70263 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lnx1O70263 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lnx1O70263 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lnx1O70263 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lnx1O70263 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lnx1O70263 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lnx1O70263 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Lnx1O70263 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lnx1O70263 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lnx1O70263 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lnx1O70263 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Lnx1O70263 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lnx1O70263 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lnx1O70263 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lnx1O70263 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Lnx1O70263 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lnx1O70263 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lnx1O70263 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Lnx1O70263 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lnx1O70263 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Lnx1O70263 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Lnx1O70263 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Lnx1O70263 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Lnx1O70263 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Lnx1O70263 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lnx1O70263 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lnx1O70263 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lnx1O70263 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lnx1O70263 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lnx1O70263 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lnx1O70263 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lnx1O70263 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lnx1O70263 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lnx1O70263 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lnx1O70263 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lnx1O70263 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lnx1O70263 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lnx1O70263 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lnx1O70263 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lnx1O70263 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lnx1O70263 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lnx1O70263 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lnx1O70263 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lnx1O70263 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lnx1O70263 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lnx1O70263 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lnx1O70263 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lnx1O70263 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lnx1O70263 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lnx1O70263 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lnx1O70263 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lnx1O70263 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lnx1O70263 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lnx1O70263 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms