Protein–RNA interactions for Protein: O55229

Chkb, Choline/ethanolamine kinase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChkbO55229 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ChkbO55229 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ChkbO55229 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ChkbO55229 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ChkbO55229 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ChkbO55229 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ChkbO55229 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ChkbO55229 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ChkbO55229 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ChkbO55229 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ChkbO55229 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ChkbO55229 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ChkbO55229 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ChkbO55229 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ChkbO55229 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ChkbO55229 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ChkbO55229 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ChkbO55229 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ChkbO55229 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ChkbO55229 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ChkbO55229 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ChkbO55229 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ChkbO55229 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ChkbO55229 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ChkbO55229 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ChkbO55229 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ChkbO55229 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ChkbO55229 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ChkbO55229 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ChkbO55229 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ChkbO55229 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ChkbO55229 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ChkbO55229 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ChkbO55229 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ChkbO55229 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ChkbO55229 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ChkbO55229 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ChkbO55229 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ChkbO55229 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ChkbO55229 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ChkbO55229 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ChkbO55229 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ChkbO55229 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ChkbO55229 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ChkbO55229 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ChkbO55229 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ChkbO55229 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ChkbO55229 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ChkbO55229 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ChkbO55229 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ChkbO55229 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ChkbO55229 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ChkbO55229 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ChkbO55229 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ChkbO55229 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ChkbO55229 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ChkbO55229 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ChkbO55229 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ChkbO55229 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ChkbO55229 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ChkbO55229 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ChkbO55229 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ChkbO55229 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ChkbO55229 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ChkbO55229 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ChkbO55229 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ChkbO55229 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ChkbO55229 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ChkbO55229 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ChkbO55229 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ChkbO55229 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ChkbO55229 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ChkbO55229 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ChkbO55229 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ChkbO55229 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ChkbO55229 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ChkbO55229 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ChkbO55229 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ChkbO55229 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ChkbO55229 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ChkbO55229 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ChkbO55229 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ChkbO55229 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ChkbO55229 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ChkbO55229 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ChkbO55229 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ChkbO55229 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ChkbO55229 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ChkbO55229 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ChkbO55229 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ChkbO55229 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ChkbO55229 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ChkbO55229 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ChkbO55229 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ChkbO55229 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ChkbO55229 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ChkbO55229 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ChkbO55229 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ChkbO55229 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ChkbO55229 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms