Protein–RNA interactions for Protein: O55203

Ldb2, LIM domain-binding protein 2, mousemouse

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Length 373 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb2O55203 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ldb2O55203 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ldb2O55203 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Ldb2O55203 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
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Ldb2O55203 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ldb2O55203 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ldb2O55203 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
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Ldb2O55203 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ldb2O55203 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ldb2O55203 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ldb2O55203 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Ldb2O55203 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ldb2O55203 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ldb2O55203 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ldb2O55203 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ldb2O55203 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ldb2O55203 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ldb2O55203 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Ldb2O55203 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Ldb2O55203 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Ldb2O55203 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Ldb2O55203 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Ldb2O55203 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Ldb2O55203 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Ldb2O55203 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Ldb2O55203 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ldb2O55203 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ldb2O55203 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ldb2O55203 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ldb2O55203 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ldb2O55203 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ldb2O55203 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ldb2O55203 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ldb2O55203 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ldb2O55203 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Ldb2O55203 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ldb2O55203 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ldb2O55203 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ldb2O55203 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ldb2O55203 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ldb2O55203 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ldb2O55203 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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