Protein–RNA interactions for Protein: O55112

Aff2, AF4/FMR2 family member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aff2O55112 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Aff2O55112 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Aff2O55112 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Aff2O55112 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Aff2O55112 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Aff2O55112 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Aff2O55112 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Aff2O55112 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Aff2O55112 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Aff2O55112 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Aff2O55112 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Aff2O55112 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Aff2O55112 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Aff2O55112 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Aff2O55112 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Aff2O55112 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Aff2O55112 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Aff2O55112 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Aff2O55112 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Aff2O55112 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Aff2O55112 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Aff2O55112 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Aff2O55112 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Aff2O55112 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Aff2O55112 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Aff2O55112 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Aff2O55112 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Aff2O55112 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Aff2O55112 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Aff2O55112 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Aff2O55112 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Aff2O55112 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Aff2O55112 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Aff2O55112 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Aff2O55112 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Aff2O55112 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Aff2O55112 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Aff2O55112 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Aff2O55112 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Aff2O55112 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Aff2O55112 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Aff2O55112 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Aff2O55112 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Aff2O55112 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Aff2O55112 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Aff2O55112 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Aff2O55112 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Aff2O55112 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Aff2O55112 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Aff2O55112 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Aff2O55112 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Aff2O55112 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Aff2O55112 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Aff2O55112 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Aff2O55112 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Aff2O55112 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Aff2O55112 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Aff2O55112 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Aff2O55112 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Aff2O55112 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Aff2O55112 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Aff2O55112 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Aff2O55112 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Aff2O55112 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Aff2O55112 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Aff2O55112 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Aff2O55112 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Aff2O55112 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Aff2O55112 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Aff2O55112 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Aff2O55112 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Aff2O55112 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Aff2O55112 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Aff2O55112 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Aff2O55112 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Aff2O55112 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Aff2O55112 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Aff2O55112 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Aff2O55112 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Aff2O55112 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Aff2O55112 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Aff2O55112 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Aff2O55112 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Aff2O55112 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Aff2O55112 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Aff2O55112 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Aff2O55112 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Aff2O55112 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Aff2O55112 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Aff2O55112 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Aff2O55112 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Aff2O55112 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Aff2O55112 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Aff2O55112 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Aff2O55112 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Aff2O55112 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Aff2O55112 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Aff2O55112 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Aff2O55112 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Aff2O55112 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms