Protein–RNA interactions for Protein: O55028

Bckdk, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, mousemouse

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Length 412 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdkO55028 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
BckdkO55028 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
BckdkO55028 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
BckdkO55028 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
BckdkO55028 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
BckdkO55028 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
BckdkO55028 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
BckdkO55028 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
BckdkO55028 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
BckdkO55028 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
BckdkO55028 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
BckdkO55028 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
BckdkO55028 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
BckdkO55028 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
BckdkO55028 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
BckdkO55028 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
BckdkO55028 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
BckdkO55028 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
BckdkO55028 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
BckdkO55028 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
BckdkO55028 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
BckdkO55028 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
BckdkO55028 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
BckdkO55028 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
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BckdkO55028 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
BckdkO55028 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
BckdkO55028 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
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BckdkO55028 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
BckdkO55028 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
BckdkO55028 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
BckdkO55028 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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BckdkO55028 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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BckdkO55028 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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BckdkO55028 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
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BckdkO55028 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
BckdkO55028 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
BckdkO55028 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
BckdkO55028 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
BckdkO55028 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
BckdkO55028 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
BckdkO55028 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
BckdkO55028 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
BckdkO55028 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
BckdkO55028 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
BckdkO55028 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
BckdkO55028 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
BckdkO55028 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
BckdkO55028 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
BckdkO55028 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
BckdkO55028 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
BckdkO55028 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
BckdkO55028 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
BckdkO55028 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
BckdkO55028 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
BckdkO55028 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
BckdkO55028 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
BckdkO55028 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
BckdkO55028 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
BckdkO55028 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
BckdkO55028 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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