Protein–RNA interactions for Protein: O54942

Cldn5, Claudin-5, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn5O54942 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Cldn5O54942 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn5O54942 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn5O54942 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn5O54942 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn5O54942 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn5O54942 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Cldn5O54942 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn5O54942 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn5O54942 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn5O54942 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn5O54942 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Cldn5O54942 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Cldn5O54942 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn5O54942 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Cldn5O54942 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn5O54942 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Cldn5O54942 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn5O54942 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn5O54942 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cldn5O54942 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
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Cldn5O54942 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn5O54942 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn5O54942 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Cldn5O54942 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn5O54942 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn5O54942 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Cldn5O54942 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn5O54942 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn5O54942 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn5O54942 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn5O54942 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn5O54942 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn5O54942 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn5O54942 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn5O54942 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn5O54942 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn5O54942 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn5O54942 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn5O54942 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn5O54942 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn5O54942 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn5O54942 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn5O54942 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn5O54942 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn5O54942 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn5O54942 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn5O54942 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms