Protein–RNA interactions for Protein: O54887

Tsks, Testis-specific serine kinase substrate, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TsksO54887 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TsksO54887 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TsksO54887 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TsksO54887 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TsksO54887 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TsksO54887 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TsksO54887 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TsksO54887 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TsksO54887 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TsksO54887 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TsksO54887 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TsksO54887 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TsksO54887 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TsksO54887 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TsksO54887 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TsksO54887 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TsksO54887 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TsksO54887 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TsksO54887 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TsksO54887 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TsksO54887 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TsksO54887 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TsksO54887 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TsksO54887 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TsksO54887 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TsksO54887 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TsksO54887 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TsksO54887 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TsksO54887 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TsksO54887 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TsksO54887 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TsksO54887 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TsksO54887 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TsksO54887 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TsksO54887 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TsksO54887 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TsksO54887 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TsksO54887 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TsksO54887 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TsksO54887 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TsksO54887 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TsksO54887 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TsksO54887 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TsksO54887 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TsksO54887 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TsksO54887 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TsksO54887 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TsksO54887 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TsksO54887 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TsksO54887 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TsksO54887 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TsksO54887 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TsksO54887 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TsksO54887 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TsksO54887 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TsksO54887 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TsksO54887 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TsksO54887 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TsksO54887 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TsksO54887 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TsksO54887 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TsksO54887 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TsksO54887 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TsksO54887 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TsksO54887 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TsksO54887 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TsksO54887 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TsksO54887 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TsksO54887 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TsksO54887 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TsksO54887 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TsksO54887 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TsksO54887 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TsksO54887 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TsksO54887 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TsksO54887 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TsksO54887 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TsksO54887 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TsksO54887 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TsksO54887 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TsksO54887 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TsksO54887 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TsksO54887 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TsksO54887 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TsksO54887 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TsksO54887 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TsksO54887 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TsksO54887 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TsksO54887 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TsksO54887 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TsksO54887 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TsksO54887 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TsksO54887 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TsksO54887 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TsksO54887 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TsksO54887 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TsksO54887 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TsksO54887 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TsksO54887 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TsksO54887 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms