Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DffaO54786 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
DffaO54786 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DffaO54786 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DffaO54786 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DffaO54786 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DffaO54786 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DffaO54786 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DffaO54786 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DffaO54786 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DffaO54786 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DffaO54786 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DffaO54786 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DffaO54786 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DffaO54786 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DffaO54786 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DffaO54786 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DffaO54786 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DffaO54786 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DffaO54786 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DffaO54786 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DffaO54786 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DffaO54786 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DffaO54786 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DffaO54786 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DffaO54786 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DffaO54786 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DffaO54786 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
DffaO54786 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DffaO54786 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DffaO54786 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DffaO54786 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DffaO54786 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DffaO54786 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DffaO54786 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DffaO54786 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DffaO54786 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DffaO54786 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DffaO54786 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DffaO54786 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
DffaO54786 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DffaO54786 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DffaO54786 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DffaO54786 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DffaO54786 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
DffaO54786 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DffaO54786 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DffaO54786 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
DffaO54786 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DffaO54786 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DffaO54786 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DffaO54786 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DffaO54786 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DffaO54786 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DffaO54786 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DffaO54786 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DffaO54786 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DffaO54786 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DffaO54786 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DffaO54786 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DffaO54786 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DffaO54786 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DffaO54786 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DffaO54786 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DffaO54786 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DffaO54786 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
DffaO54786 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DffaO54786 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DffaO54786 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DffaO54786 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DffaO54786 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
DffaO54786 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DffaO54786 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
DffaO54786 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
DffaO54786 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DffaO54786 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DffaO54786 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DffaO54786 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DffaO54786 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DffaO54786 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DffaO54786 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DffaO54786 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DffaO54786 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
DffaO54786 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DffaO54786 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DffaO54786 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DffaO54786 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DffaO54786 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DffaO54786 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DffaO54786 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DffaO54786 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DffaO54786 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DffaO54786 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DffaO54786 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DffaO54786 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DffaO54786 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DffaO54786 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DffaO54786 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DffaO54786 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DffaO54786 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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