Protein–RNA interactions for Protein: O35711

Ppfibp2, Liprin-beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfibp2O35711 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ppfibp2O35711 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Ppfibp2O35711 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ppfibp2O35711 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ppfibp2O35711 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ppfibp2O35711 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ppfibp2O35711 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ppfibp2O35711 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ppfibp2O35711 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ppfibp2O35711 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ppfibp2O35711 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ppfibp2O35711 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ppfibp2O35711 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ppfibp2O35711 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ppfibp2O35711 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ppfibp2O35711 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ppfibp2O35711 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Ppfibp2O35711 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ppfibp2O35711 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ppfibp2O35711 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ppfibp2O35711 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ppfibp2O35711 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ppfibp2O35711 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Ppfibp2O35711 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Ppfibp2O35711 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ppfibp2O35711 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ppfibp2O35711 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ppfibp2O35711 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ppfibp2O35711 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ppfibp2O35711 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ppfibp2O35711 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ppfibp2O35711 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ppfibp2O35711 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ppfibp2O35711 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Ppfibp2O35711 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ppfibp2O35711 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ppfibp2O35711 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ppfibp2O35711 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ppfibp2O35711 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ppfibp2O35711 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ppfibp2O35711 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ppfibp2O35711 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ppfibp2O35711 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ppfibp2O35711 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ppfibp2O35711 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ppfibp2O35711 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ppfibp2O35711 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ppfibp2O35711 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ppfibp2O35711 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ppfibp2O35711 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ppfibp2O35711 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ppfibp2O35711 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ppfibp2O35711 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ppfibp2O35711 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ppfibp2O35711 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ppfibp2O35711 Gm11434-201ENSMUST00000122379 629 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Ppfibp2O35711 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ppfibp2O35711 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ppfibp2O35711 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Ppfibp2O35711 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ppfibp2O35711 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Ppfibp2O35711 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ppfibp2O35711 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ppfibp2O35711 mt-Rnr1-201ENSMUST00000082388 955 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Ppfibp2O35711 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ppfibp2O35711 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ppfibp2O35711 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ppfibp2O35711 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ppfibp2O35711 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Ppfibp2O35711 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ppfibp2O35711 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ppfibp2O35711 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ppfibp2O35711 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ppfibp2O35711 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ppfibp2O35711 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ppfibp2O35711 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ppfibp2O35711 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ppfibp2O35711 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ppfibp2O35711 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ppfibp2O35711 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
Ppfibp2O35711 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ppfibp2O35711 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ppfibp2O35711 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ppfibp2O35711 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ppfibp2O35711 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ppfibp2O35711 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ppfibp2O35711 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ppfibp2O35711 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ppfibp2O35711 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Ppfibp2O35711 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ppfibp2O35711 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ppfibp2O35711 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ppfibp2O35711 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ppfibp2O35711 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ppfibp2O35711 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ppfibp2O35711 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ppfibp2O35711 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ppfibp2O35711 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ppfibp2O35711 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ppfibp2O35711 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms