Protein–RNA interactions for Protein: O35474

Edil3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edil3O35474 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Edil3O35474 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Edil3O35474 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Edil3O35474 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Edil3O35474 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Edil3O35474 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Edil3O35474 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Edil3O35474 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Edil3O35474 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Edil3O35474 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Edil3O35474 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Edil3O35474 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Edil3O35474 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Edil3O35474 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Edil3O35474 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Edil3O35474 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Edil3O35474 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Edil3O35474 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Edil3O35474 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Edil3O35474 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Edil3O35474 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Edil3O35474 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Edil3O35474 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Edil3O35474 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Edil3O35474 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Edil3O35474 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Edil3O35474 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Edil3O35474 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Edil3O35474 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Edil3O35474 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Edil3O35474 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Edil3O35474 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Edil3O35474 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Edil3O35474 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Edil3O35474 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Edil3O35474 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Edil3O35474 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Edil3O35474 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Edil3O35474 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Edil3O35474 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Edil3O35474 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Edil3O35474 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Edil3O35474 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Edil3O35474 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Edil3O35474 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Edil3O35474 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Edil3O35474 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Edil3O35474 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Edil3O35474 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Edil3O35474 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Edil3O35474 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Edil3O35474 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Edil3O35474 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Edil3O35474 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Edil3O35474 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Edil3O35474 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Edil3O35474 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Edil3O35474 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Edil3O35474 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Edil3O35474 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Edil3O35474 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Edil3O35474 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Edil3O35474 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Edil3O35474 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Edil3O35474 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Edil3O35474 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Edil3O35474 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Edil3O35474 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Edil3O35474 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Edil3O35474 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Edil3O35474 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Edil3O35474 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Edil3O35474 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Edil3O35474 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Edil3O35474 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Edil3O35474 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Edil3O35474 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Edil3O35474 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Edil3O35474 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Edil3O35474 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Edil3O35474 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Edil3O35474 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Edil3O35474 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Edil3O35474 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Edil3O35474 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Edil3O35474 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Edil3O35474 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Edil3O35474 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Edil3O35474 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Edil3O35474 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Edil3O35474 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Edil3O35474 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Edil3O35474 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Edil3O35474 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Edil3O35474 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Edil3O35474 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Edil3O35474 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Edil3O35474 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Edil3O35474 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Edil3O35474 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms