Protein–RNA interactions for Protein: O35424

H2-Ob, Histocompatibility 2, O region beta locus, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-ObO35424 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
H2-ObO35424 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
H2-ObO35424 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2-ObO35424 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2-ObO35424 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2-ObO35424 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2-ObO35424 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2-ObO35424 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2-ObO35424 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2-ObO35424 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2-ObO35424 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2-ObO35424 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2-ObO35424 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2-ObO35424 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2-ObO35424 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2-ObO35424 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2-ObO35424 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2-ObO35424 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2-ObO35424 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
H2-ObO35424 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2-ObO35424 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
H2-ObO35424 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2-ObO35424 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2-ObO35424 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2-ObO35424 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2-ObO35424 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2-ObO35424 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
H2-ObO35424 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2-ObO35424 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2-ObO35424 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2-ObO35424 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2-ObO35424 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2-ObO35424 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2-ObO35424 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2-ObO35424 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2-ObO35424 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2-ObO35424 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2-ObO35424 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2-ObO35424 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2-ObO35424 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
H2-ObO35424 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2-ObO35424 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2-ObO35424 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2-ObO35424 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2-ObO35424 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2-ObO35424 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
H2-ObO35424 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2-ObO35424 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2-ObO35424 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2-ObO35424 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2-ObO35424 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2-ObO35424 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2-ObO35424 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2-ObO35424 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2-ObO35424 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2-ObO35424 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2-ObO35424 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2-ObO35424 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
H2-ObO35424 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2-ObO35424 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2-ObO35424 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2-ObO35424 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2-ObO35424 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2-ObO35424 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2-ObO35424 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2-ObO35424 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2-ObO35424 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2-ObO35424 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2-ObO35424 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
H2-ObO35424 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2-ObO35424 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2-ObO35424 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2-ObO35424 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2-ObO35424 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2-ObO35424 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2-ObO35424 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2-ObO35424 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2-ObO35424 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2-ObO35424 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2-ObO35424 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2-ObO35424 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2-ObO35424 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2-ObO35424 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2-ObO35424 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2-ObO35424 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2-ObO35424 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2-ObO35424 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2-ObO35424 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2-ObO35424 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2-ObO35424 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2-ObO35424 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2-ObO35424 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
H2-ObO35424 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2-ObO35424 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2-ObO35424 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2-ObO35424 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2-ObO35424 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2-ObO35424 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2-ObO35424 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2-ObO35424 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.9 ms