Protein–RNA interactions for Protein: O35348

Colq, Acetylcholinesterase collagenic tail peptide, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ColqO35348 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ColqO35348 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ColqO35348 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ColqO35348 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ColqO35348 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ColqO35348 Esp36-201ENSMUST00000172814 1117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ColqO35348 Esp36-202ENSMUST00000177882 1117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ColqO35348 A330048O09Rik-201ENSMUST00000180777 672 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ColqO35348 Gm43049-202ENSMUST00000198942 559 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ColqO35348 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
ColqO35348 Pafah1b1-ps2-201ENSMUST00000207209 1223 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
ColqO35348 Gm19395-201ENSMUST00000219618 646 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ColqO35348 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
ColqO35348 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ColqO35348 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ColqO35348 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ColqO35348 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ColqO35348 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ColqO35348 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ColqO35348 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ColqO35348 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ColqO35348 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ColqO35348 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ColqO35348 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ColqO35348 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ColqO35348 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ColqO35348 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ColqO35348 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ColqO35348 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ColqO35348 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ColqO35348 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ColqO35348 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ColqO35348 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ColqO35348 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ColqO35348 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ColqO35348 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ColqO35348 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ColqO35348 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ColqO35348 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ColqO35348 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ColqO35348 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
ColqO35348 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
ColqO35348 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
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ColqO35348 Gm45359-201ENSMUST00000210635 427 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
ColqO35348 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
ColqO35348 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ColqO35348 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ColqO35348 Gm5169-201ENSMUST00000096469 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ColqO35348 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ColqO35348 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ColqO35348 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ColqO35348 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ColqO35348 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ColqO35348 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ColqO35348 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ColqO35348 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ColqO35348 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ColqO35348 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ColqO35348 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ColqO35348 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ColqO35348 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ColqO35348 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ColqO35348 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ColqO35348 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ColqO35348 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ColqO35348 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ColqO35348 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ColqO35348 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ColqO35348 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ColqO35348 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ColqO35348 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ColqO35348 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ColqO35348 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ColqO35348 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ColqO35348 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
ColqO35348 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ColqO35348 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ColqO35348 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ColqO35348 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
ColqO35348 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ColqO35348 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ColqO35348 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ColqO35348 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ColqO35348 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
ColqO35348 Gm37533-201ENSMUST00000193848 545 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
ColqO35348 Fam24a-202ENSMUST00000207439 711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ColqO35348 AC153512.2-201ENSMUST00000220363 1273 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ColqO35348 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
ColqO35348 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
ColqO35348 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ColqO35348 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ColqO35348 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
ColqO35348 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ColqO35348 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ColqO35348 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ColqO35348 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ColqO35348 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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