Protein–RNA interactions for Protein: O35309

Nmi, N-myc-interactor, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NmiO35309 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NmiO35309 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NmiO35309 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NmiO35309 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NmiO35309 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NmiO35309 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NmiO35309 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NmiO35309 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NmiO35309 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NmiO35309 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NmiO35309 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NmiO35309 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
NmiO35309 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NmiO35309 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
NmiO35309 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NmiO35309 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
NmiO35309 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NmiO35309 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NmiO35309 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NmiO35309 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NmiO35309 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NmiO35309 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NmiO35309 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NmiO35309 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NmiO35309 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NmiO35309 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NmiO35309 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NmiO35309 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
NmiO35309 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NmiO35309 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NmiO35309 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NmiO35309 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NmiO35309 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NmiO35309 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NmiO35309 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NmiO35309 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NmiO35309 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NmiO35309 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NmiO35309 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NmiO35309 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NmiO35309 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NmiO35309 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NmiO35309 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NmiO35309 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NmiO35309 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NmiO35309 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NmiO35309 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NmiO35309 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NmiO35309 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
NmiO35309 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NmiO35309 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NmiO35309 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NmiO35309 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NmiO35309 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NmiO35309 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NmiO35309 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NmiO35309 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NmiO35309 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NmiO35309 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NmiO35309 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NmiO35309 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NmiO35309 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
NmiO35309 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
NmiO35309 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NmiO35309 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NmiO35309 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
NmiO35309 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NmiO35309 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NmiO35309 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
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NmiO35309 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NmiO35309 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NmiO35309 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NmiO35309 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NmiO35309 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NmiO35309 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NmiO35309 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NmiO35309 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NmiO35309 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NmiO35309 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NmiO35309 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NmiO35309 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NmiO35309 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NmiO35309 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NmiO35309 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NmiO35309 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
NmiO35309 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NmiO35309 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NmiO35309 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NmiO35309 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
NmiO35309 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
NmiO35309 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NmiO35309 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NmiO35309 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NmiO35309 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NmiO35309 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NmiO35309 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NmiO35309 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NmiO35309 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms