Protein–RNA interactions for Protein: O35304

Slc18a3, Vesicular acetylcholine transporter, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc18a3O35304 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slc18a3O35304 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slc18a3O35304 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Slc18a3O35304 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Slc18a3O35304 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Slc18a3O35304 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Slc18a3O35304 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Slc18a3O35304 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Slc18a3O35304 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Slc18a3O35304 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Slc18a3O35304 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Slc18a3O35304 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Slc18a3O35304 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Slc18a3O35304 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Slc18a3O35304 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Slc18a3O35304 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Slc18a3O35304 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Slc18a3O35304 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Slc18a3O35304 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Slc18a3O35304 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Slc18a3O35304 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Slc18a3O35304 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Slc18a3O35304 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Slc18a3O35304 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Slc18a3O35304 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Slc18a3O35304 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Slc18a3O35304 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Slc18a3O35304 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Slc18a3O35304 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Slc18a3O35304 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Slc18a3O35304 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Slc18a3O35304 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Slc18a3O35304 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Slc18a3O35304 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Slc18a3O35304 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Slc18a3O35304 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Slc18a3O35304 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Slc18a3O35304 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slc18a3O35304 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slc18a3O35304 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slc18a3O35304 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slc18a3O35304 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slc18a3O35304 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slc18a3O35304 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slc18a3O35304 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slc18a3O35304 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slc18a3O35304 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slc18a3O35304 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Slc18a3O35304 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slc18a3O35304 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slc18a3O35304 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Slc18a3O35304 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slc18a3O35304 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slc18a3O35304 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Slc18a3O35304 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slc18a3O35304 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slc18a3O35304 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slc18a3O35304 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slc18a3O35304 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slc18a3O35304 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slc18a3O35304 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slc18a3O35304 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slc18a3O35304 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slc18a3O35304 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slc18a3O35304 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slc18a3O35304 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slc18a3O35304 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slc18a3O35304 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Slc18a3O35304 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Slc18a3O35304 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Slc18a3O35304 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Slc18a3O35304 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Slc18a3O35304 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Slc18a3O35304 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Slc18a3O35304 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Slc18a3O35304 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Slc18a3O35304 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Slc18a3O35304 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Slc18a3O35304 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Slc18a3O35304 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Slc18a3O35304 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Slc18a3O35304 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Slc18a3O35304 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Slc18a3O35304 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Slc18a3O35304 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Slc18a3O35304 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Slc18a3O35304 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Slc18a3O35304 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Slc18a3O35304 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Slc18a3O35304 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Slc18a3O35304 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Slc18a3O35304 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Slc18a3O35304 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Slc18a3O35304 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Slc18a3O35304 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Slc18a3O35304 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Slc18a3O35304 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Slc18a3O35304 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Slc18a3O35304 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Slc18a3O35304 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 255.9 ms