Protein–RNA interactions for Protein: O35245

Pkd2, Polycystin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2O35245 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Pkd2O35245 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pkd2O35245 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pkd2O35245 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pkd2O35245 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pkd2O35245 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pkd2O35245 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Pkd2O35245 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pkd2O35245 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pkd2O35245 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pkd2O35245 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pkd2O35245 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pkd2O35245 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pkd2O35245 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pkd2O35245 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pkd2O35245 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pkd2O35245 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pkd2O35245 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pkd2O35245 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pkd2O35245 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pkd2O35245 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pkd2O35245 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Pkd2O35245 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pkd2O35245 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pkd2O35245 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pkd2O35245 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pkd2O35245 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Pkd2O35245 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Pkd2O35245 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pkd2O35245 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pkd2O35245 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pkd2O35245 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pkd2O35245 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pkd2O35245 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pkd2O35245 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pkd2O35245 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pkd2O35245 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pkd2O35245 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pkd2O35245 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pkd2O35245 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pkd2O35245 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pkd2O35245 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pkd2O35245 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pkd2O35245 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pkd2O35245 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pkd2O35245 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pkd2O35245 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pkd2O35245 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pkd2O35245 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pkd2O35245 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Pkd2O35245 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pkd2O35245 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pkd2O35245 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pkd2O35245 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pkd2O35245 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pkd2O35245 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pkd2O35245 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pkd2O35245 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pkd2O35245 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Pkd2O35245 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pkd2O35245 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pkd2O35245 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Pkd2O35245 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Pkd2O35245 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pkd2O35245 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pkd2O35245 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pkd2O35245 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pkd2O35245 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pkd2O35245 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pkd2O35245 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pkd2O35245 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pkd2O35245 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pkd2O35245 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pkd2O35245 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pkd2O35245 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pkd2O35245 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pkd2O35245 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pkd2O35245 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pkd2O35245 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pkd2O35245 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pkd2O35245 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pkd2O35245 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pkd2O35245 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Pkd2O35245 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pkd2O35245 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pkd2O35245 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pkd2O35245 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pkd2O35245 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pkd2O35245 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pkd2O35245 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pkd2O35245 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pkd2O35245 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pkd2O35245 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pkd2O35245 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pkd2O35245 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pkd2O35245 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pkd2O35245 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pkd2O35245 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pkd2O35245 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pkd2O35245 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms