Protein–RNA interactions for Protein: O35182

Smad6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad6O35182 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smad6O35182 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smad6O35182 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smad6O35182 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smad6O35182 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smad6O35182 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smad6O35182 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smad6O35182 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smad6O35182 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smad6O35182 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smad6O35182 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smad6O35182 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smad6O35182 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smad6O35182 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smad6O35182 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smad6O35182 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smad6O35182 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smad6O35182 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smad6O35182 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smad6O35182 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smad6O35182 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Smad6O35182 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smad6O35182 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smad6O35182 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smad6O35182 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smad6O35182 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smad6O35182 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smad6O35182 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smad6O35182 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smad6O35182 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smad6O35182 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Smad6O35182 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smad6O35182 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smad6O35182 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smad6O35182 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smad6O35182 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Smad6O35182 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smad6O35182 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smad6O35182 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smad6O35182 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smad6O35182 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smad6O35182 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smad6O35182 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smad6O35182 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smad6O35182 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smad6O35182 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smad6O35182 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smad6O35182 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smad6O35182 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smad6O35182 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smad6O35182 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smad6O35182 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smad6O35182 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smad6O35182 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Smad6O35182 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smad6O35182 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Smad6O35182 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smad6O35182 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smad6O35182 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smad6O35182 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smad6O35182 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smad6O35182 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smad6O35182 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smad6O35182 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smad6O35182 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smad6O35182 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smad6O35182 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smad6O35182 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smad6O35182 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smad6O35182 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smad6O35182 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smad6O35182 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Smad6O35182 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smad6O35182 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smad6O35182 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smad6O35182 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smad6O35182 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smad6O35182 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smad6O35182 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smad6O35182 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Smad6O35182 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smad6O35182 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smad6O35182 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smad6O35182 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Smad6O35182 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Smad6O35182 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smad6O35182 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Smad6O35182 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smad6O35182 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Smad6O35182 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smad6O35182 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smad6O35182 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smad6O35182 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smad6O35182 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smad6O35182 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smad6O35182 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smad6O35182 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smad6O35182 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smad6O35182 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smad6O35182 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms