Protein–RNA interactions for Protein: O35114

Scarb2, Lysosome membrane protein 2, mousemouse

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarb2O35114 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Scarb2O35114 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Scarb2O35114 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Scarb2O35114 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Scarb2O35114 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Scarb2O35114 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Scarb2O35114 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Scarb2O35114 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Scarb2O35114 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Scarb2O35114 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Scarb2O35114 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Scarb2O35114 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Scarb2O35114 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Scarb2O35114 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Scarb2O35114 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Scarb2O35114 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Scarb2O35114 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Scarb2O35114 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Scarb2O35114 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Scarb2O35114 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Scarb2O35114 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Scarb2O35114 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Scarb2O35114 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Scarb2O35114 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Scarb2O35114 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Scarb2O35114 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Scarb2O35114 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Scarb2O35114 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Scarb2O35114 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Scarb2O35114 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Scarb2O35114 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Scarb2O35114 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Scarb2O35114 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Scarb2O35114 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Scarb2O35114 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Scarb2O35114 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Scarb2O35114 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Scarb2O35114 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Scarb2O35114 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Scarb2O35114 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Scarb2O35114 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Scarb2O35114 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Scarb2O35114 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Scarb2O35114 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Scarb2O35114 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Scarb2O35114 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Scarb2O35114 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Scarb2O35114 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Scarb2O35114 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Scarb2O35114 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Scarb2O35114 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Scarb2O35114 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Scarb2O35114 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Scarb2O35114 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Scarb2O35114 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Scarb2O35114 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Scarb2O35114 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Scarb2O35114 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Scarb2O35114 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Scarb2O35114 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Scarb2O35114 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Scarb2O35114 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Scarb2O35114 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Scarb2O35114 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Scarb2O35114 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Scarb2O35114 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Scarb2O35114 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Scarb2O35114 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Scarb2O35114 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
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Scarb2O35114 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Scarb2O35114 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Scarb2O35114 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Scarb2O35114 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Scarb2O35114 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Scarb2O35114 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Scarb2O35114 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Scarb2O35114 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Scarb2O35114 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Scarb2O35114 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Scarb2O35114 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Scarb2O35114 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Scarb2O35114 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Scarb2O35114 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Scarb2O35114 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Scarb2O35114 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Scarb2O35114 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Scarb2O35114 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Scarb2O35114 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Scarb2O35114 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Scarb2O35114 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Scarb2O35114 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Scarb2O35114 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Scarb2O35114 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Scarb2O35114 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Scarb2O35114 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Scarb2O35114 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Scarb2O35114 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Scarb2O35114 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Scarb2O35114 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms